Im Rahmen des jährlichen Studientreffens der AGO-Studiengruppe(Arbeitsgemeinschaft Gynäkologische Onkologie) am 18.11.2011 in Berlin wurde der Frauenklinik als Auszeichnung für die qualitativ besonders hochwertige Durchführung von Studien zur Optimierung der Behandlung von Patientinnen mit gynäkologischen Malignomen der "Preis für Projekthandling AGO-Studien" verliehen.

Im September 2007 wurde der Frauenklinik für das Projekt "Vertrag zur integrierten Versorgung zur Verhinderung von Gebärmutterhalskrebs" der Hospital-Innovationspreis 2007 der RFH (Rheinischen Fachhochschule Köln) und der CardinalHealth Deutschland verliehen.

Im Rahmen des jährlichen Studientreffens der Studiengruppe OVAR der AGO (Arbeitsgemeinschaft Gynäkologische Onkologie) am 23.11.2007 in Mainz wurde der Frauenklinik als Auszeichnung für die qualitativ besonders hochwertige Durchführung von Studien zur Optimierung der Behandlung von Eierstockkrebserkrankungen der "Preis für Datenqualität" verliehen.